Varian Virus Corona Baru Strain 501Y-V2 dari Afrika Selatan
Pada 18 Desember 2020, Afrika Selatan mendeteksi mutan 501Y-V2 dari virus corona baru.Kini mutan Afrika Selatan telah menyebar ke lebih dari 20 negara.Eksperimen telah menunjukkan bahwa di atas Mutan Virus Corona Baru dapat membawa varian Coronavirus Baru lainnya dari mutasi K417N/T, E484K dan N501Y yang dapat mengurangi kemampuan penetralan antibodi penetral plasma yang diinduksi vaksin.Namun, dibandingkan dengan genom referensi Wuh01 (nomor urut MN908947), 501Y.V2 dari urutan genom mutan Afrika Selatan memiliki 23 varian nukleotida.Ia memiliki mutasi N501Y yang sama dengan sub-tipe B.1.1.7 mutan Inggris, tetapi masih mengandung mutasi pada dua situs kunci E484K dan K417N dari protein S yang berpotensi berpengaruh penting pada kemampuan virus untuk menginfeksi.
Coronavirus Baru adalah Virus RNA untai tunggal, yang mutasi Genomnya lebih sering.Deteksi target tunggal dapat dengan mudah menyebabkan hilangnya deteksi sampel dengan viral load rendah dan strain virus yang bermutasi.Tingkat pemeriksaan ulang dalam satu positif dalam deteksi target, dapat mencapai lebih dari 10%, yang dapat meningkatkan beban kerja dan memperpanjang waktu diagnosis.Deteksi multi-target dan verifikasi timbal balik dari hasil setiap target dapat meningkatkan tingkat deteksi dan memfasilitasi diagnosis dini.
Gambar 1. Diagram skema mekanisme infeksi New Coronavirus
Virus Corona Mutan B.1.1.7 Baru dari Inggris
Pada tanggal 26 Desember 2020, karya ilmiah pertama Strain B.1.1.7 diterbitkan secara online.Institute of Hygiene University of London UK and Tropical Diseases, menegaskan bahwa Strain B.1.1.7 lebih mampu menyebar dibandingkan strain lainnya, yaitu lebih dari 56% (95% CI 50-74%).Karena strain mutan baru ini memiliki kekuatan transmisi yang lebih jelas, menjadi lebih sulit untuk mengendalikan COVID-19.Keesokan harinya, University of Birmingham di Inggris mengunggah sebuah artikel di MedRxiv.Studi ini menemukan bahwa jumlah salinan gen virus ORF1ab dan N pada pasien yang terinfeksi galur mutan B.1.1.7 (keluar dari gen S) meningkat secara signifikan;fenomena ini dipantau dalam populasi.Artikel ini menunjukkan bahwa pasien yang terinfeksi dengan mutan B.1.1.7 dari Inggris memiliki viral load yang jauh lebih tinggi, jadi mutan ini mungkin juga lebih patogen.
Gambar 2. Urutan mutasi genom yang terkandung dalam strain mutan coronavirus B.1.1.7 dari Inggris
Gambar 3. Mutasi N501Y terjadi di Inggris dan Afrika SelatanVarian
Kit Deteksi Varian Coronavirus Baru
Chuangkun Biotech Inc. telah berhasil mengembangkan kit deteksi untuk varian virus corona baru B.1.1.7 dan 501Y-V2.
Keunggulan produk ini: sensitivitas tinggi，deteksi 4 target secara simultan, meliputi lokasi mutasi utama strain mutan B.1.1.7 dan strain mutan Afrika Selatan 501Y.V2.Kit ini dapat secara simultan mendeteksi situs mutasi N501Y, HV69-70del, E484K dan gen coronavirus S baru;Tes cepat: hanya membutuhkan waktu 1 jam 30 menit dari pengambilan sampel hingga hasilnya.
Gambar 4. Deteksi Kurva Amplifikasi Varian Inggris COVID-19
Gambar 5. Deteksi Kurva Amplifikasi Varian Afrika Selatan COVID-19
Gambar 6. Tipe liar dari kurva amplifikasi virus corona baru
Tidak jelas bagaimana mutasi ini mengakumulasi dampak jangka panjang baru dari pandemi COVID-19 kan.Tetapi ini mengingatkan kita bahwa mutasi ini dapat mempengaruhi efektivitas kekebalan alami dan kekebalan yang ditimbulkan oleh vaksinasi.Ini juga mengingatkan kita bahwa kita perlu terus memantau virus corona baru untuk waktu yang lama dan memperbarui vaksin COVID-19 untuk menghadapi evolusi virus corona baru.
Waktu posting: Mar-12-2021