CHKBiotech berhasil mengembangkan kit deteksi untuk varian virus korona baru

Strain Varian Coronavirus Baru 501Y-V2 Afrika Selatan
Pada 18 Desember 2020, Afrika Selatan mendeteksi mutan 501Y-V2 dari virus korona baru. Kini mutan Afrika Selatan telah menyebar ke lebih dari 20 negara. Eksperimen telah menunjukkan bahwa di atas Mutan virus Corona baru dapat membawa varian Virus Corona Baru lainnya dari mutasi K417N / T, E484K dan N501Y yang dapat mengurangi kemampuan menetralkan antibodi penawar plasma yang diinduksi oleh vaksin. Namun dibandingkan dengan genom referensi Wuh01 (nomor urut MN908947), urutan genom mutan 501Y.V2 Afrika Selatan memiliki 23 varian nukleotida. Ia memiliki mutasi N501Y yang sama dengan subtipe mutan Inggris B.1.1.7, tetapi masih mengandung mutasi pada dua situs utama protein S E484K dan K417N yang memiliki efek penting potensial pada kemampuan virus untuk menginfeksi.

Virus Corona Baru adalah Virus RNA Untai Tunggal, yang mutasi Genomnya lebih sering. Deteksi target tunggal dapat dengan mudah mengakibatkan kesalahan deteksi sampel dengan viral load rendah dan jenis virus yang bermutasi. Tingkat pemeriksaan ulang pada single positive pada target deteksi dapat mencapai lebih dari 10%, yang dapat meningkatkan beban kerja dan memperpanjang waktu diagnosa. Deteksi multi-target dan saling verifikasi hasil setiap target dapat meningkatkan tingkat deteksi dan memfasilitasi diagnosis dini.

news1

Gambar 1. Diagram skema mekanisme infeksi New Coronavirus

Coronavirus Mutant B.1.1.7 baru dari Inggris
Pada tanggal 26 Desember 2020, karya ilmiah pertama Strain B.1.1.7 dipublikasikan secara online. Institute of Hygiene University of London UK and Tropical Diseases, mengkonfirmasi bahwa Strain B.1.1.7 lebih mampu menyebar dibandingkan dengan strain lainnya, yaitu lebih dari 56% (95% CI 50-74%). Karena strain mutan baru ini memiliki daya transmisi yang lebih jelas, pengendalian COVID-19 menjadi lebih sulit. Keesokan harinya, Universitas Birmingham di Inggris mengunggah artikel di MedRxiv. Studi tersebut menemukan bahwa jumlah salinan gen virus ORF1ab dan N pada pasien yang terinfeksi strain mutan B.1.1.7 (dropout gen S) meningkat secara signifikan; fenomena ini dipantau di populasi. Artikel ini menunjukkan bahwa pasien yang terinfeksi dengan mutan B.1.1.7 dari Inggris memiliki viral load yang lebih tinggi secara signifikan, jadi mutan ini mungkin juga lebih patogen.

1

Gambar 2. Urutan mutasi genom yang terdapat pada virus corona strain mutan B.1.1.7 Inggris

2

Gambar 3. Mutasi N501Y terjadi di Inggris dan Afrika Selatan Varian

Kit Deteksi Varian Coronavirus Baru
Chuangkun Biotech Inc. telah berhasil mengembangkan kit deteksi untuk varian virus korona baru B.1.1.7 dan 501Y-V2.

Keunggulan produk ini: sensitivitas tinggi, deteksi simultan dari 4 target, yang mencakup lokasi mutasi utama strain mutan B.1.1.7 dan strain mutan Afrika Selatan 501Y.V2. Kit ini dapat secara bersamaan mendeteksi situs mutasi N501Y, HV69-70del, E484K dan gen S Coronavirus baru; Tes cepat: hanya membutuhkan waktu 1 jam 30 menit dari pengambilan sampel sampai hasil.

3

Gambar 4. Deteksi Kurva Amplifikasi Varian Inggris COVID-19

4

Gambar 5. Deteksi Kurva Amplifikasi Varian Afrika Selatan COVID-19

5

Gambar 6. Kurva amplifikasi Coronavirus tipe baru

Tidak jelas bagaimana mutasi ini mengakumulasi dampak jangka panjang baru dari hak pandemi COVID-19. Tetapi ini mengingatkan kita bahwa mutasi ini dapat mempengaruhi keefektifan kekebalan alami dan kekebalan yang ditimbulkan oleh vaksinasi. Ini juga mengingatkan kita bahwa kita perlu terus memantau virus corona baru dalam waktu yang lama dan memperbarui vaksin COVID-19 untuk menghadapi evolusi virus corona baru.


Waktu posting: Mar-12-2021